Por decisión de la Junta Directiva Internacional se han creado Comisiones y Comités específicos con carácter temporal o permanente, para cumplir con los propósitos de OPTIMA. En la actualidad, las siguientes comisiones y comités están abiertos y son activos:
Comisiones y Comités específicos de OPTIMA:
- Comisión sobre briofitos
- Comisión de plantas exóticas de la zona Mediterránea
- Comisión para los nombres vulgares de plantas
- Comisión para la investigación del DNA
- Comisión para la conservación de plantas importantes económicamente y plantas endémicas
- Comisión para la difusión del conocimiento de las plantas mediterráneas
- Comisión sobre hongos
- Comisión itinera mediterranea
- Comisión sobre liquenes
- Comisión sobre el material tipo de taxones mediterráneos
- Comisión del herbario y la biblioteca de OPTIMA
- Comisión sobre cariosistemática
- Etnobotánica mediterranea
- Comisión de premios
- Comisión WEB